7 прогалин в діагностиці грибкових інфекцій

Загроза зростання грибкових інфекцій серед популяції пацієнтів з певними захворюваннями (наприклад, онкологією або після трансплантації) зараз є досить високою. Діагностика інвазивних грибкових інфекцій часто встановлюється із запізненням, а поточні методики не завжди є адекватними. Загальна кількість грибкових інфекцій порівняно з бактерійними та вірусними невелика, але смертність є високою. Тому швидкість діагностики грибків є пріоритетною. Крім того, з’являється мультирезистентність до Candida auris та Aspergillus fumigatus.

Однак за останні десятиліття було досягнуто незначного прогресу в покращенні діагностики грибкових інфекцій. Для спільного розв'язання діагностичної проблеми було створено консорціум лабораторної діагностики грибків (FDLC). Він складається з 26 лабораторій США та Канади, які регулярно проводять ідентифікацію грибів. Нещодавно було завершено дослідження можливостей діагностики грибкових інфекцій серед учасників консорціуму.

Виявлено такі прогалини в діагностиці:

1. Відсутність молекулярного виявлення мукормікозу;

2. Відсутність оптимального діагностичного алгоритму, що включає грибкові біомаркери та молекулярні інструменти для ранньої та точної діагностики Пневмоцистної пневмонії, аспергільозу, кондидемії, ендемічних мікозів;

3. Відсутність стандартизованого молекулярного підходу для ідентифікації грибкових патогенів безпосередньо у фіксованих формаліном тканинах, залитих парафіном;

4. Відсутність надійних баз даних для покращення ідентифікації цвілевих грибів за допомогою часопролітної мас-спектрометрії;

5. Субоптимальні діагностичні підходи для посіву крові на цвілеві грибки, обробки культури тканин для Mucorales та посіву на респіраторні грибки для пацієнтів з кістозним фіброзом;

6. Недостатня можливість для тестування на грибки в місці надання допомоги та недостатня можливість ідентифікації нових та рідкісних грибкових патогенів;

7. Виконання тестів на протигрибкову чутливість.

В дослідженні FDLC окреслюється найбільш нагальні та невирішені діагностичні потреби та висловлюються експертні думки про те, як їх вирішити.

матеріал написаний на основі статті: Zhang SX, Babady NE, Hanson KE, Harrington AT, Larkin PMK, Leal SM Jr, Luethy PM, Martin IW, Pancholi P, Procop GW, Riedel S, Seyedmousavi S, Sullivan KV, Walsh TJ, Lockhart SR; Fungal Diagnostics Laboratories Consortium (FDLC). Recognition of Diagnostic Gaps for Laboratory Diagnosis of Fungal Diseases: Expert Opinion from the Fungal Diagnostics Laboratories Consortium (FDLC). J Clin Microbiol. 2021 Jun 18;59(7):e0178420. doi: 10.1128/JCM.01784-20. Epub 2021 Jun 18. PMID: 33504591; PMCID: PMC8218742.